[hal-00525256] Motifs Séquentiels Discriminants pour les puces ADN

Découvrir de nouvelles informations sur les groupes de gènes impliqués dans une maladie est un véritable challenge. Les puces ADN sont des outils puissants pour l'analyse des expressions de gènes. Elles mesurent l'expression de milliers de gènes dans différentes conditions biologiques. Dans cet article, nous proposons une nouvelle approche mettant en évidence des relations d'ordre entre les expressions de gènes. Tout d'abord, nous extrayons des motifs séquentiels qui peuvent être utilisés comme matériel d'étude par les biologistes. Or, comme la densité des bases issues des puces à ADN rend difficile l'extraction de ces motifs, nous introduisons une source de connaissances pendant le processus de fouille. De cette manière, l'espace de recherche est réduit et les résultats obtenus sont plus pertinents d'un point de vue biologique. Les expérimentations sur des données réelles soulignent la pertinence de notre proposition.



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